Verantwortlich dafür ist der "vereinfachte Test" für die grundsätzliche Frage "Wann sind 2 Punkte gleich?"

Für Allplan sind sie das, wenn die Abweichung der Koordinatenwerte in jeder Richtung (XYZ) jeweils kleiner als der minimale Punktabstand ist.

Damit sind P1 und P2 im ungedrehten Zustand nicht gleich, aber sobald man das Koordinatensystem (oder die Punkte) um 45° dreht, sind die Punkte P1 und P2' plötzlich gleich, und verusachen eine "kritische Geometrie"!
Auch wenn P1 und P2' die "Ausgangslage bilden, und dann 2 verschiedenen Punkte darstellen, werden P1 und P2 nach der Drehung plötzlich zu einem Punkt!

Richtig wäre es, wenn man den korrekten Punktabstand von P1 zu P2 ermittelt:
dist = sqrt((x1-x2)²+(y1-y2)²+(z1-z2)²)
da sich dieser bei Drehung (beider Punkte) nicht ändert.
Aber das bedeutet mind. 3 Multiplikationen mehr.

Die Grafik zeigt aber auch, dass das Problem nur eines ist, wenn die Punkte weniger als sqrt(2) (1,414213562373095) * min_dist auseinanderliegen.
Das scheint dann bei Dir der Fall zu sein, und ist vermutlich auf das Zeichnen mit einem nicht immer korrekt gedrehten Fadenkreuz bzw. Grundrissdarstellung zurückzuführen.
Der Systemwinkel wird z.B. immer noch mit nur 3 Kommastellen angezeigt, obwohl hier wesentlich mehr nötig sind, um genau zu zeichnen! Man sollte dafür eigentlich immer einen Projektwinkel definieren, und zwar ausreichend genau!

Hierzu gibt es bereits Verbesserungvorschläge, die aber bisher nicht "erhört" wurden.

Natürlich hängt das mit "unsauberen" Drehungen des Systemwinkels zusammen.

Da würde ich jetzt nicht zu doll auf Allplan zeigen, diese Probleme sind "hausgemacht"!

Bei gedrehten Grundrissen/Grundrsisdarstellung kommt es fast immer zu solchen Problemen.
Ihr seid da nicht allein!

Allplan könnte und sollte meines Erachtens jedoch mehr tun, um "genaues Arbeiten" zu unterstützen.
Vorschläge gibt es genügend, z.B. auch diesen hier zum Punktfang.

Wenn das Kind schon in den Brunnen gefallen ist, hilft nur, mit dem ModelInspector die Modell-Geometrie zu untersuchen und alle Fehler zu bereinigen.
Das kann aufändig werden, bis hin zum Neuzeichnen. Deshalb soltle man lieber ein wenig mehr Zeit in die "Genauigkeit" beim Arbeiten investieren. "Quick" ist meist auch "dirty" ...

Was habt ihr überhaupt eingestellt bei minimaler Punktabstand ?

Bleibt das jetzt einfach so schlecht oder ist man bemüht für die Problem Lösungen zu finden ?
Vorschläge von den User hat es ja.

Leider können wir unsere Gebäude nicht schön parallel zur X-Achse ausrichten, da wir georeferenziert arbeiten.