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Das Verspringen des Bauteils "Rolladenkasten" quer zur Wandachse hat seinen Grund darin, dass dieses Bauteil (wie der Sturz auch)
nicht für eine größere Dicke/Tiefe als die Wand, in der es eingebaut ist, gemacht ist!

Bei einem Update verspringt der Rolladenkasten auf die andere Seite, sodass er nicht mehr in die 2. Schicht reinragt!
Das kann man komisch finden, aber bei der Programmierung scheint sich jemand etwas dabei gedacht zu haben. Möglicherwiese aber das Falsche...
D.h. die Aussparung in der 2. Schicht, die der Rolladenkasten nach dem Erzeugen noch so wunderbar generiert, hat bei der nächsten Änderung keinen Bestand!

Workaround:
Wenn das Fenster unbedingt in die Dämmschicht hineinragen muss, dann ist es angeraten, die Dämmschicht in 2 Schichten aufzuteilen.
Zumindest im Bereich des Fensters wird es wohl auch so ausgeführt werden müssen, also als 2-lagige Dämmung!
Und dann braucht man überhaupt kein Bauteil Rolladenkasten, sondern kommt mit dem Rolladen das Fenster-SmartParts aus.

Wenn man dann unbedingt noch einen Rolladenkasten/Sturz einfügen möchte, dann sollte man wieder in jede Schicht einen Rolladenkasten/Sturz einbauen. Nicht schön, aber es funktioniert.

Fazit:
In Allplan ist man immer gut beraten, so zu konstruieren, wie es später gebaut wird.
Und wenn man dazu partiell die äussere Wandschicht teilen muss, dann ist es eben so!
Es hilft nicht, gegen die intern verdrahtete Logik von Allplan "anzuarbeiten", und gefrustet immer wieder dasselbe zu versuchen.
Besser, man versucht zu ergründen, warum manches so ist, wie es ist, und macht sich die Logik zu Nutze!

Wenn man sich schon wundert, sollte man sich immer zu Ende wundern!